GMV incrementa amb la seva tecnologia la seguretat dels fàrmacs a la plataforma de dades biomèdiques ToxHub
Després de cinc anys de recerca, el consorci eTRANSAFE (*) ha finalitzat les seves investigacions amb la presentació de la revolucionària plataforma de dades biomèdiques ToxHub. El projecte, que ha estat finançat amb gairebé 40 milions d’euros procedents de fons europeus i de la Federació Europea d’Empreses i Associacions Farmacèutiques, ha disposat de la tecnologia de la multinacional tecnològica GMV, amb presència a Catalunya, per al desenvolupament de la plataforma de dades biomèdiques d’eTRANSAFE.
La plataforma d’informació en línia ha centralitzat l’accés a totes aquestes fonts i bases de dades toxicològiques i ecotoxicològiques. GMV ha contribuït al desenvolupament d’aquesta plataforma i ha estat responsable tècnic del sistema. En el marc del projecte, s’ha desenvolupat una estratègia i arquitectura tecnològica d’avantguarda per compartir dades preclíniques i clíniques de les diverses fonts, així com per a la integració i explotació d’aquestes.
Per comprendre l’abast de la plataforma de dades biomèdiques ToxHub, cal tenir en compte que l’avaluació de la seguretat dels medicaments és un procés intensiu en coneixement, que exigeix avenços en els mètodes i eines per tractar dades i facilitar-ne la integració, així com en la seva anàlisi i modelatge predictiu. Aquesta necessitat requereix la integració d’informació de diferents fonts (tant públiques com propietàries) que continguin coneixement biomèdic rellevant (clínics o preclínics, evidència d’estudis, etc.).
Fins a la posada en marxa del projecte eTRANSAFE, les companyies farmacèutiques no havien compartit la informació de què disposaven sobre la toxicitat de milers de compostos, extreta en assajos amb animals. La majoria d’aquestes dades romanien en sitges privades sense possibilitat de posar-se en comú. Gràcies a la plataforma ToxHub és possible fer assajos més eficaços per a l’avaluació de la seguretat dels fàrmacs, i reemplaçar part dels estudis amb animals per tecnologia d’anàlisi retrospectiva a partir de l’evidència acumulada per la indústria farmacèutica.
Com assenyala Adrián Rodrigo, Business Solutions for Smart Health de GMV, per poder assolir l’objectiu del projecte, «en primer lloc hem hagut d’organitzar i compartir, aplicant tècniques de governança de dades, tota la informació disponible de les empreses farmacèutiques». Calia «generar un volum suficient de dades biomèdiques perquè la tecnologia de dades massives i els mètodes computacionals poguessin extreure’n conclusions, informació que, sense aquestes tecnologies, no hauria pogut processar-se».
El projecte ha desenvolupat eines in silico (via simulació computacional) per a l’extracció de dades, la visualització i predicció de la toxicitat potencial, amb especial atenció a l’avaluació de l’acord entre els estudis preclínics i clínics i al descobriment de biomarcadors de seguretat.
ToxHub reuneix bases de dades preclíniques i clíniques (amb les quals poder analitzar fins a quin punt els estudis preclínics són adequats per predir el que succeeix en humans), en una infraestructura de dades integradora, combinada amb eines informàtiques i de visualització innovadores que tenen per objectiu millorar radicalment la predictibilitat, viabilitat i confiabilitat de l’avaluació de la seguretat traslacional durant el procés de desenvolupament de fàrmacs. El benefici directe és poder fer assajos més eficaços, reduir els temps de les investigacions i aconseguir nous medicaments més segurs.
Redisseny dels programes d’estudis preclínics
ToxHub genera, per tant, un impacte significatiu en com es realitzen els estudis preclínics i com la indústria els dissenya. eTRANSAFE s’ha centrat en l’avaluació de la seguretat traslacional i a identificar quan i en quina mesura les observacions toxicològiques preclíniques poden predir reaccions adverses clíniques als medicaments. Fins ara, els enfocaments quimioinformàtics s’han basat en gran manera en la predicció computacional de la interacció quimicobiològica i les conseqüències posteriors per als resultats adversos dels medicaments. Tanmateix, encara s’ha integrat poca informació toxicològica mecanicista a les estratègies de toxicologia computacional.
Anteriorment, la falta d’interaccions directes amb toxicòlegs experimentals ha obstaculitzat el progrés per verificar les eines predictives en l’àmbit biològic. Al contrari, els toxicòlegs experimentals han generat quantitats massives de dades basades en proves in vivo amb animals, sense integrar sistemàticament els avenços de la quimioinformàtica i la bioinformàtica. Aquest intercanvi i integració de dades és possible i molt valuós. L’ambició del projecte eTRANSAFE ha estat precisament ampliar la integració amb la quimioinformàtica, la bioinformàtica, la toxicologia experimental i la seguretat clínica dels medicaments i aprofitar al màxim l’experiència única present a Europa en aquestes àrees.
********