Després de cinc anys de recerca, el consorci eTRANSAFE (*) ha finalitzat les seves investigacions amb la presentació de la revolucionària plataforma de dades biomèdiques ToxHub. El projecte, que ha estat finançat amb gairebé 40 milions d’euros procedents de fons europeus i de la Federació Europea d’Empreses i Associacions Farmacèutiques, ha disposat de la tecnologia de GMV, amb presència a Catalunya, per al desenvolupament de la plataforma de dades biomèdiques d’eTRANSAFE.

La plataforma d’informació en línia ha centralitzat l’accés a totes aquestes fonts i bases de dades toxicològiques i ecotoxicològiques. GMV ha contribuït al desenvolupament d’aquesta plataforma i ha estat responsable tècnic del sistema. En el marc del projecte, s’ha desenvolupat una estratègia i arquitectura tecnològica d’avantguarda per compartir dades preclíniques i clíniques de les diverses fonts, així com per a la integració i explotació d’aquestes.

Per comprendre l’abast de la plataforma de dades biomèdiques ToxHub, cal tenir en compte que l’avaluació de la seguretat dels medicaments és un procés intensiu en coneixement, que exigeix avenços en els mètodes i eines per tractar dades i facilitar-ne la integració, així com en la seva anàlisi i modelatge predictiu. Aquesta necessitat requereix la integració d’informació de diferents fonts (tant públiques com propietàries) que continguin coneixement biomèdic rellevant (clínics o preclínics, evidència d’estudis, etc.).

Fins a la posada en marxa del projecte eTRANSAFE, les companyies farmacèutiques no havien compartit la informació de què disposaven sobre la toxicitat de milers de compostos, extreta en assajos amb animals. La majoria d’aquestes dades romanien en sitges privades sense possibilitat de posar-se en comú. Gràcies a la plataforma ToxHub és possible fer assajos més eficaços per a l’avaluació de la seguretat dels fàrmacs, i reemplaçar part dels estudis amb animals per tecnologia d’anàlisi retrospectiva a partir de l’evidència acumulada per la indústria farmacèutica.

El projecte ha desenvolupat eines in silico (via simulació computacional) per a l’extracció de dades, la visualització i predicció de la toxicitat potencial, amb especial atenció a l’avaluació de l’acord entre els estudis preclínics i clínics i al descobriment de biomarcadors de seguretat.

ToxHub reuneix bases de dades preclíniques i clíniques (amb les quals poder analitzar fins a quin punt els estudis preclínics són adequats per predir el que succeeix en humans), en una infraestructura de dades integradora, combinada amb eines informàtiques i de visualització innovadores que tenen per objectiu millorar radicalment la predictibilitat, viabilitat i confiabilitat de l’avaluació de la seguretat traslacional durant el procés de desenvolupament de fàrmacs. El benefici directe és poder fer assajos més eficaços, reduir els temps de les investigacions i aconseguir nous medicaments més segurs.

(*) eTRANSAFE té una participació publicoprivada que inclou 8 institucions acadèmiques, 8 pimes i 13 empreses farmacèutiques. Els socis espanyols del projecte són l’Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques (coordinador), la Universitat Pompeu Fabra, GMV Soluciones Globales Internet SAU, MedBioInformatics Solutions SL i Synapse Research Management Partners SL i el Barcelona Supercomputing Center com a part d’ELIXIR, que hi han participat liderant 4 dels 10 paquets de treball del projecte. Els coordinadors industrials han estat les farmacèutiques Novartis i Bayer AG. GMV, d’altra banda, ha desenvolupat una avançada infraestructura d’integració de dades, aplicant estàndards oberts i polítiques àmpliament acceptades per les parts, incloses les agències reguladores i les organitzacions internacionals.