Tras cinco años de investigación, el consorcio eTRANSAFE (*) ha finalizado sus investigaciones con la presentación de la revolucionaria plataforma de datos biomédicos ToxHub. El proyecto, que ha sido financiado con casi 40 millones de euros procedentes de fondos europeos y de la Federación Europea de Empresas y Asociaciones Farmacéuticas, ha contado con la tecnología de GMV para el desarrollo de la plataforma de datos biomédicos de eTRANSAFE.

La plataforma de información online ha centralizado el acceso a todas estas fuentes y bases de datos toxicológicos y ecotoxicológicos. GMV ha contribuido al desarrollo de esta plataforma y ha sido responsable técnico del sistema. En el marco del proyecto, se ha desarrollado una estrategia y arquitectura tecnológica de vanguardia para compartir datos preclínicos y clínicos de las diversas fuentes, así como para la integración y explotación de estos.

Para comprender el alcance de la plataforma de datos biomédicos ToxHub, hay que tener en cuenta que la evaluación de la seguridad de los medicamentos es un proceso intensivo en conocimiento, que exige avances en los métodos y herramientas para manejar datos y facilitar la integración de estos, así como en su análisis y modelado predictivo. Esta necesidad requiere la integración de información de diferentes fuentes (tanto públicas como propietarias) que contengan conocimiento biomédico relevante (clínicos o preclínicos, evidencia de estudios, etc.).

Hasta la puesta en marcha del proyecto eTRANSAFE, las compañías farmacéuticas no habían compartido la información que disponían sobre la toxicidad de miles de compuestos, extraída en ensayos con animales. La mayoría de estos datos permanecían en silos privados sin posibilidad de ponerse en común. Gracias a la plataforma ToxHub es posible realizar ensayos más eficaces para la evaluación de la seguridad de los fármacos, reemplazando parte de los estudios con animales por tecnología de análisis retrospectivo, a partir de la evidencia acumulada por la industria farmacéutica.

El proyecto ha desarrollado herramientas in silico (vía simulación computacional) para la extracción de datos, la visualización y predicción de la toxicidad potencial, con especial atención a la evaluación del acuerdo entre los estudios preclínicos y clínicos y al descubrimiento de biomarcadores de seguridad.

ToxHub reúne bases de datos preclínicas y clínicas (con las que poder analizar hasta qué punto los estudios preclínicos son adecuados para predecir lo que ocurre en humanos), en una infraestructura de datos integradora, combinada con herramientas informáticas y de visualización innovadoras que tienen como objetivo mejorar radicalmente la predictibilidad, viabilidad y confiabilidad de la evaluación de la seguridad traslacional durante el proceso de desarrollo de fármacos. El beneficio directo es poder realizar ensayos más eficaces, reducir los tiempos de las investigaciones y conseguir nuevos medicamentos más seguros.

(*) eTRANSAFE cuenta con una participación público-privada que incluye 8 instituciones académicas, 8 PYMES y 13 empresas farmacéuticas. Los socios españoles del proyecto son el Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques (coordinador), la Universidad Pompeu Fabra, GMV Soluciones Globales Internet SAU, MedBioInformatics Solutions SL y Synapse Research Management Partners SL y el Barcelona Supercomputing Center como parte de ELIXIR, que han participado liderando 4 de los 10 paquetes de trabajo del proyecto. Los coordinadores industriales han sido las farmacéuticas Novartis y Bayer AG. GMV por su parte ha desarrollado una avanzada infraestructura de integración de datos, aplicando estándares abiertos y políticas ampliamente aceptadas por las partes, incluidas las agencias reguladoras y las organizaciones internacionales.